簡(jiǎn)介
二代測(cè)序技術(shù)在科研、醫(yī)療等領(lǐng)域應(yīng)用廣泛，而選擇合適的測(cè)序儀器是確保實(shí)驗(yàn)順利開(kāi)展和結(jié)果可靠的關(guān)鍵。對(duì)于剛接觸二代測(cè)序的新手而言，面對(duì)多樣的儀器往往難以辨別其差異。為此，我們整理了主流二代測(cè)序儀器的核心信息，希望能幫助新手快速理清它們的區(qū)別，為項(xiàng)目中的儀器選擇提供有效參考。
主流二代測(cè)序儀器核心參數(shù)對(duì)比表
儀器品牌 型號(hào) | 核心測(cè)序原理 | 測(cè)序讀長(zhǎng) 范圍 | 典型通量 （單詞運(yùn)行） | 準(zhǔn)確率 Q30 | 主要優(yōu)勢(shì) |
Illumina NovaSeq | 邊合成邊測(cè)序 | 100-300bp | 最高可達(dá) 6Tb | ≥90% | 高通量模式下數(shù)據(jù)產(chǎn)出效率高，適用于大型基因組項(xiàng)目和多樣本并行分析，數(shù)據(jù)穩(wěn)定性強(qiáng) |
Illumina HiSeq | 邊合成邊測(cè)序 | 50-300bp | 最高可達(dá) 1.5Tb | ≥90% | 在中小規(guī)模項(xiàng)目中性價(jià)比突出，測(cè)序精度穩(wěn)定，適合常規(guī)轉(zhuǎn)錄組、外顯子組等檢測(cè) |
華大 DNBSEQ-T7 | 基于DNA納米球和聯(lián)合探針錨定聚合技術(shù) | 50-150bp | 最高可達(dá) 10Tb | ≥90% | 通量極高，單位數(shù)據(jù)成本較低，適合大規(guī)模人群隊(duì)列研究、全基因組關(guān)聯(lián)分析等大型項(xiàng)目 |
技術(shù)細(xì)節(jié)補(bǔ)充
測(cè)序原理影響：Illumina的邊合成邊測(cè)序原理，通過(guò)在DNA合成過(guò)程中加入熒光標(biāo)記的核苷酸，實(shí)現(xiàn)對(duì)序列的讀取，這種方式保證了較高的測(cè)序準(zhǔn)確率，但在通量提升上相對(duì)受限。華大DNBSEQ技術(shù)通過(guò)DNA納米球放大信號(hào)，減少了擴(kuò)增偏差，在保證準(zhǔn)確率的同時(shí)，能實(shí)現(xiàn)更高的通量。
數(shù)據(jù)質(zhì)量相關(guān)：Q30是衡量測(cè)序質(zhì)量的重要指標(biāo)，代表堿基識(shí)別錯(cuò)誤率低于1/1000。上述儀器均能達(dá)到較高的Q30水平，可滿足大部分科研和應(yīng)用需求。在實(shí)際應(yīng)用中，可根據(jù)具體項(xiàng)目對(duì)數(shù)據(jù)質(zhì)量的細(xì)微要求進(jìn)行選擇。
選擇建議
選擇建議：若您的項(xiàng)目是大型基因組研究，且對(duì)數(shù)據(jù)產(chǎn)出量要求極高，華大 DNBSEQ-T7 是優(yōu)先選擇；若為中小規(guī)模的精準(zhǔn)測(cè)序項(xiàng)目，Illumina HiSeq能滿足需求；對(duì)于需要大量高質(zhì)量數(shù)據(jù)的大型科研項(xiàng)目，Illumina NovaSeq更為合適。
參考文獻(xiàn)
[1]https://pdf.medicalexpo.com/pdf/illumina-inc/hiseq-3000-hiseq-4000-sequencing-systems/83632-140628.html
[2]https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/novaseq-x-plus/applications/transition.html
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